在肛瘘病症中流脓是主要症状，脓液多少和瘘管的长短与多少有关，新生瘘管流脓较多，会刺激皮肤引起皮肤瘙痒不适，当外口阻塞或假性愈合，瘘管内脓液积存，局部肿胀疼痛，甚至发热，以后封闭的瘘口破溃，症状方始消失。
由于引流不畅，脓肿反复发作，也可溃破出现多个外口。较大较高位的肛瘘，常有粪便或气体从外口排出。
1、排脓：排脓是肛瘘的主要早期症状。一般来说，新生成的瘘管排脓较多，脓汁粘稠，*色、味臭;瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水;若脓量增加，则表示新瘘管生成。瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升，以后封闭的瘘口破溃，又排出脓液，也可从瘘口排出气体或粪便。
2、瘙痒：肛门部皮肤由于脓液及其他排出物刺激，脓液不断刺激肛周皮肤，常感觉皮肤瘙痒。肛周潮湿不适，皮肤变色、表皮脱落，纤维组织增生和增厚，有时形成湿疹。
3、疼痛：瘘管通畅无炎症时，一般无疼痛，只有肛门局部略有肿胀感，行走时可加重，若外口封闭，瘘管存积脓液，或粪便进入瘘管，则会疼痛加重或排粪时疼痛加重，而内盲瘘则常感直肠下部和肛门部灼热不适，排粪时疼痛加重。
4、硬结或瘢痕：由于瘘管壁及瘘口的反复刺激，使纤维组织增生，在管壁和瘘口形成质韧的结缔组织，常表现为瘘管周围皮肤变色，表皮脱落，凹陷变形，触及条索状硬结通向肛门内。
肛瘘初期病发症状表现大体上包括以上几个方面的内容，当肛瘘疾病在一个人的身体上形成之后，机体各个方面的健康状况都会产生相应的一些变化，此时则需要我们的肛瘘病患者能够在肛瘘病发早期抓紧时间针对自身的病症表现来选择一种适合的肛瘘治疗方法进行身体疾病的科学医治，争取及早康复。
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